Shift in Candida species causing candidemia: A seven-year study from a university hospital and evaluation of the rise of Candida parapsilosis sensu stricto

Abstract

Background

Candidemia ranks the fourth most prevalent infection in healthcare settings. Notably, non-Candida albicansCandida species, particularly Candida parapsilosis, have experienced a worldwide increase as causative agents of candidemia in recent years.

Aims

This study aimed to assess shifts in prevalence and antifungal susceptibility of C. parapsilosis among candidemia-causing species over time, alongside investigating clonal relationships among isolates.

Methods

We analyzed Candida species in candidemia episodes from January 2016 to December 2022. MALDI-TOF MS identified Candida isolates at the species level, and the identification of the species within C. parapsilosis complex was achieved via the restriction fragment length polymorphism method. Fluconazole susceptibility testing followed EUCAST guidelines. Clonal relationships among C. parapsilosis isolates were assessed using three methods: AP-PCR, REA-PFGE, and electrophoretic karyotyping.

Results

Across a seven-year period, Candida prevalence among all blood cultures was 2.1% (679 cases). The most prevalent Candida species were C. parapsilosis (33.7%), C.albicans (32.7%), Nakaseomyces glabratus (formerly Candida glabrata) (14.4%), and Candida tropicalis (8%). Notably, C. parapsilosis isolation rates increased annually from 2016 to 2022. Fluconazole susceptibility of C. parapsilosis isolates declined over time, with rates decreasing from 100% in 2016 to 72.6% in 2022. Electrophoretic karyotyping exhibited superior discrimination in clonal relationship analysis (D = 0.9875).

Conclusions

Our findings highlight a concerning trend of increasing fluconazole resistance in C. parapsilosis sensu stricto over the study period. Electrophoretic karyotyping has emerged as a robust method for assessing clonal relationships. While no dominant outbreak isolate was identified, the high clustering rate suggests the potential of C. parapsilosis as a significant nosocomial infection agent in the future.

Resumen

Antecedentes

La candidemia es la cuarta infección más prevalente en los centros sanitarios. En particular, las especies de Candida no-Candida albicans, especialmente Candida parapsilosis, han experimentado en los últimos años un aumento mundial como agentes causantes de candidemia.

Objetivos

El objetivo de este estudio fue evaluar los cambios en la prevalencia de especies responsables de candidemia, así como la sensibilidad antifúngica de C.parapsilosis a lo largo del tiempo, además de investigar las relaciones clonales entre los aislamientos.

Métodos

Se identificaron las especies de Candida en episodios de candidemia desde enero de 2016 hasta diciembre de 2022. Mediante la técnica MALDI-TOF MS se identificaron las especies de Candida; para la identificación de las especies dentro del complejo C.parapsilosis se utilizó el método de polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción. Las pruebas de sensibilidad al fluconazol siguieron las directrices marcadas por EUCAST. Las relaciones clonales entre los aislamientos de C.parapsilosis se evaluaron mediante tres métodos: AP-PCR, REA-PFGE y cariotipado electroforético.

Resultados

A lo largo de un periodo de siete años, el aislamiento de Candida en todos los hemocultivos fue del 2,1% (679 casos). Las especies de Candida más prevalentes fueron C.parapsilosis (33,7%), C.albicans (32,7%), Nakaseomyces glabratus (antes Candida glabrata) (14,4%) y Candida tropicalis (8%). Cabe destacar que la tasa de aislamiento de C.parapsilosis aumentó anualmente desde 2016 a 2022. La sensibilidad al fluconazol de los aislamientos de C.parapsilosis disminuyó con el tiempo, siendo esta sensibilidad del 100% en 2016 y del 72,6% en 2022. El cariotipado electroforético mostró una discriminación superior en el análisis de la relación clonal (D = 0,9875).

Conclusiones

Nuestros hallazgos destacan una tendencia preocupante en el aumento de la resistencia al fluconazol de C.parapsilosis sensu stricto durante el período de estudio. El cariotipado electroforético se ha revelado como un método sólido para evaluar las relaciones clonales. Aunque no se identificó ningún aislamiento dominante responsable de algún brote, la elevada tasa de agrupación sugiere que C.parapsilosis puede ser un importante agente de infección nosocomial en el futuro.