Characterization of NDM-1- and CMH-3-producing Enterobacter cloacae complex ST932 in a patient transferred from Ukraine to Spain

Abstract

Introduction

To characterize a carbapenem-resistant Enterobacter cloacae complex isolate recovered from a patient from Ukraine.

Methods

The isolate was sent to a regional reference laboratory for molecular characterization by whole genome sequencing. Susceptibility assays, carbapenemase identification, imipenem hydrolysis and clonality were performed.

Results

The isolate showed resistance or reduced susceptibility to all β-lactam agents tested. Genome analysis led to the identification of an NDM-1-producing E. cloacae complex strain that was assigned to a new multilocus sequence type, ST932. The bla_NDM-1 enzyme was located in a conjugative IncX3 plasmid of ca. 50 kb. In addition, bla_CMH-3, a recently described AmpC β-lactamase sequence, which has not previously been reported in Europe, was also detected and its genetic environment was studied.

Conclusion

To our knowledge, this is the first reported case in Europe of an E. cloacae complex strain that produces both bla_NDM-1 and bla_CMH-3.

Resumen

Introducción

Caracterizar una cepa de Enterobacter cloacae complex resistente a los carbapenémicos detectado en un paciente procedente de Ucrania.

Métodos

Se envió la cepa a un laboratorio regional de referencia para proceder a su caracterización molecular mediante secuenciación del genoma completo. Se realizaron estudios de susceptibilidad, identificación de carbapenemasas, hidrólisis del imipenem y de clonalidad.

Resultados

El aislado mostró resistencia o sensibilidad reducida a todos los betalactámicos estudiados. El análisis molecular permitió la identificación de una cepa de E. cloacae complex productor de NDM-1 que se asignó a un nuevo secuenciotipo, ST932. Se localizó la enzima bla_NDM-1 en plásmido conjugativo IncX3 de 50 kb. Además, se detectó la enzima bla_CMH-3, una nueva betalactamasa de tipo AmpC descrita recientemente pero no detectada con anterioridad en Europa, llevándose a cabo el estudio de su entorno genético.

Conclusión

Según nuestros conocimientos, esta es la primera descripción una cepa de E. cloacae complex productora de bla_NDM-1 junto con bla_CMH-3 en Europa.