La ciencia ha experimentado una transformación significativa en las últimas décadas, marcada por un cambio de paradigma que ha reconfigurado su práctica y propósito, promoviendo una mayor transparencia, colaboración y accesibilidad al conocimiento. Este movimiento no solo promueve la difusión libre y gratuita de este mismo, sino que también enfatiza la importancia de compartir los datos y resultados de la actividad científica de manera abierta y colaborativa, agilizando así los avances en la ciencia. A lo largo de estos años, el personal de investigación en el campo de la cirugía no ha estado exento de todas estas transformaciones y prácticas, viendo como cambiaban los modelos de publicación o la forma de difundir los resultados de investigación, entre otros.
En el marco de la ciencia abierta, la normativa española y europea también ha añadido ciertos requerimientos respecto a la publicación de resultados de investigación. Para proyectos financiados con fondos públicos, se solicita el depósito de una copia de la versión final aceptada de las publicaciones científicas, así como los datos asociados en repositorios de acceso abierto1. Este cambio en la normativa ha llevado a las agencias de financiación y editoriales a incorporar estos requisitos en las convocatorias y criterios de revisión, respectivamente. Como consecuencia, el personal investigador puede preguntarse ¿qué es un repositorio de acceso abierto?, ¿qué implica el depósito de mis datos en uno de estos y cuáles son los beneficios?, ¿qué aspectos debo considerar al realizar el depósito? o ¿con quién puedo contactar para que me oriente dentro de mi organización? Esta carta tiene como objetivo explicar brevemente los pasos necesarios a seguir para depositar en un repositorio y así dar solución a las dudas más comunes.
¿Qué es un repositorio de acceso abierto?Es una plataforma digital donde se almacenan y se ponen a disposición de la comunidad de forma abierta diferentes tipos de contenido académico-científico, principalmente resultados de investigación. Estos repositorios juegan un papel crucial en la promoción del acceso abierto, la transparencia de la investigación y la preservación y difusión del conocimiento científico2. Además, ayudan a cumplir con los requisitos de las agencias de financiación y revistas. Sin embargo, depositar no es sinónimo de publicar los datos libre y abiertamente. Existen fórmulas que permiten restringir, en mayor o menor medida, el acceso a los datos publicados (licencias de uso, embargo de datos, etc.). A todo objeto digital depositado en un repositorio se le asignará un Digital Object Identifier (DOI) para proporcionarle una identificación única y persistente, facilitando su citación y seguimiento a lo largo del tiempo.
¿Cómo realizar el depósito de mis datos?¿Qué repositorio debo elegir?Antes de publicar un conjunto de datos (dataset), primero hay que elegir el repositorio adecuado. Existen diferentes tipos de repositorios (editoriales o institucionales, temáticos o multidisciplinares, etc.), por lo que se deben considerar ciertos aspectos durante la elección:
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¿Mis datos son fácilmente adaptables al formato requerido?
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¿El volumen de los ficheros a depositar se ajusta a mis necesidades?
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¿Se permite la restricción de los datos si es necesario?
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¿Las licencias ofrecidas son las adecuadas de acuerdo con mis intereses?
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¿Se genera un DOI específico para mis datos?
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¿Hay costes asociados a su uso?
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¿Cuenta con una política de preservación de datos?
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¿Existe un control de versiones de los datasets?
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¿Cumple con los requisitos de las ayudas europeas o los estándares de las revistas o la comunidad científica?
Se recomienda encarecidamente la elección de repositorios que permitan el depósito de datos de acuerdo con los principios Findable, Accessible, Interoperable, Reusable (FAIR)3 y bajo las directrices de la European Open Science Cloud (EOSC), ya que son los que garantizan el cumplimiento de los estándares éticos y legales. Re3data.org4, es una herramienta muy útil para elegir un repositorio, ya que recopila los metadatos de numerosos repositorios especializados en investigación.
¿Cómo he de preparar el dataset para su depósito?El siguiente paso es la preparación de los datos para su depósito, de acuerdo con las directrices del repositorio elegido. Los requisitos más comunes incluyen la anonimización o seudonimización de los datos (en caso de contener datos identificativos), el guardado de estos en archivos de formato abierto, sostenibles y no propietarios para facilitar su preservación a largo plazo, y la descripción de los datos. Es esencial explicar cómo se han creado los datos, su contexto, estructura y contenido para favorecer su interpretación y reutilización. Para ello, durante el depósito, se requiere lo siguiente: descripción de los metadatos, que son los datos que describen el dataset (título, autor y afiliación, contacto, lenguaje, etc.); fichero Readme, documento obligatorio en formato .txt que permite comunicar información importante sobre el dataset (título, métodos, resumen de los datos y ficheros, condiciones de reutilización, etc.); y, por último, el codebooko lista de variables, el cual suele ser tabular y proporciona información completa y autoexplicativa para cada una de las variables del dataset.
¿Qué tipo de licencia de uso debo utilizar?Antes de realizar el depósito es importante definir la licencia de uso del dataset. La herramienta Licence Chooser5 que ofrece Creative Commons es muy útil para identificar la licencia más adecuada para cada caso. Algunos repositorios sugieren el uso de licencias lo más abiertas posibles (CC0 o CC BY) para garantizar la mayor reutilización de los datos. Es importante encontrar un equilibrio entre la apertura y la protección de los datos, siguiendo el principio de «tan abierto como sea posible, tan cerrado como sea necesario».
¿A quién debo acudir para la revisión del dataset?Una vez elegido el repositorio, preparados los datos y documentos adjuntos, y asignada la licencia adecuada, el siguiente paso es realizar la curación del dataset. Es recomendable que este sea revisado por el personal de soporte del centro de investigación, ya que están familiarizados con los estándares y requisitos del depósito de datos y aseguran el cumplimiento de las directrices de la ciencia abierta. Una vez completados los puntos anteriores y realizada esta revisión interna, el dataset está preparado para su publicación (fig. 1).
Ejemplo real del depósito de un dataset
Para mejorar la comprensión del proceso de depósito de un dataset y la documentación requerida, se muestra un caso real del Institut d’Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT). El Dr. Xavier Serra-Aracil contactó con el personal de soporte para poder depositar un dataset del proyecto TAUTEM6,7. Tras varias reuniones donde se discutieron y revisaron las características del dataset, el resultado del depósito fue el siguiente: Serra-Aracil X. A randomized multicenter non-inferiority phase III trial of chemoradiotherapy and local excision versus total mesorectal excision in T2–T3ab,N0,M0 rectal cancer (the TAUTEM study). CORA.Repositori de Dades de Recerca. 2024. https://doi.org/10.34810/data11818.
ConclusionesEl depósito de datos en repositorios de acceso abierto es esencial para la ciencia moderna, promoviendo transparencia, colaboración y reutilización de la información. Aunque pueda haber preocupaciones iniciales, estudios recientes muestran que el personal investigador encuentra el proceso más sencillo de lo esperado. Cuando este se realiza adecuadamente, no solo no supone ningún riesgo, sino que el depósito de datos en abierto proporciona beneficios considerables9,10. Cabe recordar que las instituciones cuentan con personal de soporte especializado para ayudar en el proceso, garantizando el cumplimiento de los requisitos legales y éticos, los cuales son cruciales para evitar errores que comprometan la integridad, reproducibilidad y seguridad de los datos. Además, existen infraestructuras y herramientas específicas que facilitan este procedimiento, haciéndolo más accesible para el personal investigador.
Fomentar el depósito de datos es una responsabilidad ética y una oportunidad para avanzar en el conocimiento científico de manera más eficaz y colaborativa. Aprovechando los recursos disponibles y solicitando ayuda cuando sea necesario, todos y todas podemos contribuir significativamente a la ciencia abierta, acelerando el progreso científico y permitiendo un acceso más amplio al conocimiento.
