Molecular identification of Candida species from urinary infections in Honduras

Abstract

Background

Candiduria is a common infection among hospitalised patients. Although the clinical relevance of yeasts in urine is not clearly defined, fungal urinary tract infections have increased significantly in the last decades, becoming a growing public health problem. Candida albicans is the most commonly reported species in urinary infections, although other species of the genus are becoming particularly important, because some of them are linked with resistance to antifungal drugs.

Aims

This study aimed to evaluate the frequency of Candida species causing candiduria in a hospital in Honduras.

Methods

A simple and cost-effective PCR-RFLP approach was used, by amplifying a partial sequence of the ribosomal ITS1-ITS2 region and a subsequent digestion with the enzyme MspI.

Results

During 2016, an analysis was performed on 73 urine samples from patients of different ages. Seven species were found. Candida albicans/dubliniensis was the most frequent species (30%); Candida glabrata (28.8%) was the most isolated among the rest of the species. Candida kefyr was the least frequent species found (2.5%).

Conclusions

This study shows, for the first time in Honduras, the frequency of the Candida species isolated from urine using PCR-RFLP for their identification. This approach could be applied in future epidemiological studies at local and national level.

Resumen

Antecedentes

La candiduria es una infección común entre pacientes hospitalizados. Aunque la relevancia clínica de las levaduras en orina aun no está del todo esclarecida, el número de infecciones urinarias por hongos se ha incrementado en las últimas décadas, convirtiéndose en un creciente problema de salud pública. Candida albicans es la levadura más común en las infecciones urinarias, si bien otras especies del género están adquiriendo importancia debido a la resistencia a las drogas antifúngicas asociada a algunas especies.

Objetivos

Este estudio pretendió evaluar la frecuencia de especies de Candida responsables de candiduria en un hospital nacional de Honduras.

Métodos

Se utilizó un análisis in silico y PCR-RFLP de una región parcial de la secuencia ribosomal ITS1-ITS2, con posterior digestión mediante la enzima MspI.

Resultados

Se analizaron 73 muestras de orina de pacientes de diferentes edades durante el año 2016. Se encontraron siete especies diferentes. Candida albicans/dubliniensis fue la especie más común (30%); Candida glabrata (28,8%) fue la más frecuente entre el resto de especies. Candida kefyr fue la especie menos encontrada (2,5%).

Conclusiones

Este estudio muestra la frecuencia de especies de Candida aisladas a partir de orina, e identificadas mediante la técnica PCR-RFLP por primera vez en Honduras. Este enfoque podría ser aplicado para futuros estudios epidemiológicos a nivel local y nacional.