Clinical and microbiological profile in obstructive biliary disease in a tertiary center: Observational study

Abstract

Aims

There is limited information on bacterial isolation, antibiotic susceptibility, and microbiological profile in obstructive biliary disease (OBD). Providing information on this could help offer more effective empirical antibiotic therapy in clinical cholangitis. This study aims to evaluate the clinical and microbiological profile in obstructive biliary disease.

Patients and methods

The study was conducted at a tertiary academic center between August 2021 and January 2023. Hospitalized patients with OBD, with indication for biliary drainage by endoscopic retrograde cholangiopancreatography, were recruited. Biliary samples were obtained following a standardized protocol, and were processed in laboratory for Gram staining, culture, subculture. Microorganisms were identified and subjected to antibiotic susceptibility testing.

Results

A total of 61 patients were included, 73.8% were women, average age was 44.8 years. Overweight/obesity was the most common comorbidity (62.3%); clinical cholangitis was present in 75.4%. Biliary lithiasis was the most common etiology of OBD (86.9%). Positive cultures were obtained in 44.3% of participants, predominating the group of Gram-positive bacteria; individually, Escherichia coli was the most isolated microorganism. A 68.2% of bacteria showed resistance to at least one antibiotic. We found significant associations between bile appearance and cholangitis, bile appearance and OBD etiology, OBD etiology and cholangitis severity. Male sex, increased age, tobacco use were associated with positive cultures. We found a spectrum of microorganisms and antibiotic susceptibilities partially different from those of Tokyo Guidelines 2018 and other publications.

Conclusions

Our findings highlight the need to characterize microbiological profile in OBD according to each region.

Resumen

Objetivos

Hay información limitada sobre el aislamiento bacteriano, la susceptibilidad a los antibióticos y el perfil microbiológico en la enfermedad biliar obstructiva (EBO). Proporcionar información sobre ello podría ayudar a ofrecer un tratamiento antibiótico empírico más eficaz en la colangitis clínica. Este estudio tiene como objetivo evaluar el perfil clínico y microbiológico en la enfermedad biliar obstructiva.

Pacientes y métodos

El estudio se realizó en un centro académico de tercer nivel entre agosto de 2021 y enero de 2023. Se reclutaron pacientes hospitalizados con EBO, con indicación de drenaje biliar mediante colangiopancreatografía retrógrada endoscópica. Se obtuvieron muestras biliares siguiendo un protocolo estandarizado, y se procesaron en laboratorio para tinción de Gram, cultivo y subcultivo. Se identificaron microorganismos, y se sometieron a pruebas de susceptibilidad a antibióticos.

Resultados

Se incluyeron 61 pacientes, el 73,8% fueron mujeres, la edad promedio fue de 44,8 años. Sobrepeso/obesidad fue la comorbilidad más común (62,3%); colangitis clínica estuvo presente en el 75,4%. Litiasis biliar fue la etiología más frecuente de la EBO (86,9%). Se obtuvieron cultivos positivos en el 44,3% de los participantes, predominando el grupo de bacterias grampositivas; individualmente, E. coli fue el microorganismo más aislado. Un 68,2% de las bacterias mostró resistencia al menos a un antibiótico. Encontramos asociaciones significativas entre apariencia de bilis y colangitis, apariencia de bilis y etiología de EBO, etiología de EBO y gravedad de colangitis. Sexo masculino, edad avanzada y el uso de tabaco se asociaron con cultivos positivos. Encontramos un espectro de microorganismos y susceptibilidad antibiótica parcialmente diferentes a las Guías Tokio 2018 y otras publicaciones.

Conclusiones

Nuestros hallazgos resaltan la necesidad de caracterizar el perfil microbiológico en la EBO, de acuerdo a cada región.