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Vol. 39. Núm. 1.
Páginas 9-13 (Enero 2021)
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Vol. 39. Núm. 1.
Páginas 9-13 (Enero 2021)
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DOI: 10.1016/j.eimc.2020.02.028
Evaluation of Vitek-MS™ and Microflex LT™ commercial systems for identification of Acinetobacter calcoaceticus–baumannii complex
Evaluación de los sistemas comerciales Vitek® MS y Microflex® LT para la identificación del complejo Acinetobacter calcoaceticus-baumannii
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Carlos Ruiz de Alegría-Puiga,
Autor para correspondencia
carlosrdap@hotmail.com

Corresponding author.
, Ana De-Malet-Pintos-Fonsecaa, Itziar Angulo-Lópeza, Jesús Agüero-Balbína,b, Francesc Marcoc,f, Rodrigo Cayôd,e, Ignasi Rocac, Jordi Vilac,f, Luis Martínez-Martínezg,h,i
a Microbiology Service, University Hospital Marqués de Valdecilla-IDIVAL, Santander, Spain
b Department of Molecular Biology, School of Medicine, University of Cantabria, Santander, Spain
c ISGlobal, Hospital Clinic – Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain
d Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório de Inmunologia e Bacteriologia (LIB), Setor de Biologia Molecular, Microbiologia e Inmunologia – Departamento de Ciências Biológicas (DCB), Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas (ICAQF), Diadema, SP, Brazil
e Universidade Federal de São Paulo – UNIFESP, Laboratório Alerta, Disciplina de Infectología, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina – EPM, São Paulo, SP, Brazil
f Department of Clinical Microbiology. Hospital Clinic-Universitat de Barcelona, Spain
g Unit of Microbiology, University Hospital Reina Sofia, Cordoba, Spain
h Department of Microbiology, University of Cordoba, Cordoba, Spain
i Maimonides Biomedical Research Institute of Cordoba (IMIBIC), Spain
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Table 1. Identification of Acinetobacter species with two MALDI-TOF MS systems.
Table 2. Comparison of Acinetobacter species belonging to the Acb complex, from University Hospital Marqués de Valdecilla, identified by different database versions of Vitek-MS™ and Microflex LT™ system.
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Abstract
Introduction

Acinetobacter is a genus that comprises a group of opportunistic pathogens responsible for a variety of nosocomial infections. The Acinetobacter calcoaceticus–Acinetobacter baumannii (Acb) complex includes some species of clinical importance, mainly A. baumannii, A. pittii and A. nosocomialis, which share phenotypic similarities that make it very difficult to distinguish between them using a phenotypic approach. The aim of this study was to evaluate two commercial matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) systems for the identification of different Acinetobacter species, with a special focus among those belonging to the Acb complex.

Methods

One hundred and fifty-six Acinetobacter spp. clinical strains, identified by amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and rpoB gene sequencing, were analysed by two different MALDI-TOF systems.

Results

Considering only the 144 strains of the Acb complex evaluated in this study, the Vitek-MS™ and Microflex LT™ systems correctly identified 129 (89.6%) and 143 (99.3%) strains, respectively.

Conclusion

After analysing 156 strains belonging to Acinetobacter spp., both Vitek-MS™ and Microflex LT™ proved to be rapid and accurate systems for the identification of Acb complex species showing a good correlation. However, both manufacturers should improve their databases to include new species in them.

Keywords:
MALDI-TOF MS
Mass spectrometry
Acinetobacter spp.
Non-fermenting Gram-negative bacilli
Resumen
Introducción

Acinetobacter es un género que comprende un grupo de patógenos oportunistas responsables de varias infecciones nosocomiales. El complejo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (Acb) reúne algunas especies de importancia clínica, principalmente A. baumannii, A. pittii y A. nosocomialis, que comparten similitudes fenotípicas que hacen muy difícil poder discriminar entre ellas utilizando un enfoque fenotípico.

El objetivo de este estudio fue evaluar 2 sistemas comerciales de espectrometría de masas de ionización por láser asistido con una matriz (MALDI-TOF MS) para la identificación de diferentes especies de Acinetobacter, con un enfoque especial entre los que pertenecen al complejo Acb.

Métodos

Analizamos 156 cepas clínicas de Acinetobacter spp., identificadas mediante análisis de restricción de ADN ribosomal amplificado (ARDRA) y secuenciación del gen rpoB, por 2 sistemas diferentes de MALDI-TOF.

Resultados

Teniendo en cuenta solo las 144 cepas del complejo Acb evaluadas en este estudio, los sistemas Vitek® MS y Microflex® LT identificaron correctamente 129 (89,6%) y 143 (99,3%) cepas, respectivamente.

Conclusión

Después de analizar 156 cepas pertenecientes a Acinetobacter spp., Vitek® MS y Microflex® LT demostraron ser sistemas rápidos y precisos para la identificación de especies del complejo Acb mostrando una buena correlación. Sin embargo, ambos fabricantes deberían mejorar sus bases de datos incluyendo nuevas especies en ellas.

Palabras clave:
MALDI-TOF MS
Espectrometría de masas
Acinetobacter spp.
Bacilos gramnegativos no fermentadores

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