Microbiological profile of bacterial and fungal corneal ulcers at a national institute of ophthalmology in Perú

Abstract

Objective

To describe the microbiological profile of bacterial and fungal corneal ulcers, as well as the antibiotic susceptibility profile of the most frequent pathogenic species.

Methods

A retrospective descriptive study was conducted using the recorded data of corneal ulcer scrapings from the ocular microbiology laboratory of the National Institute of Ophthalmology. Laboratory data from 2015 to 2022 were collected and included for all corneal ulcer scrapings.

Results

After excluding repeated, non-cultured, and duplicate results, a total of 3,470 corneal samples were analyzed. Positive samples accounted for 88.1% of all scraps. Of these, 2,816 (81.2%), 904 (26.2%), and 662 (19.1%) showed bacterial, fungal, and mixed growth, respectively. Coagulase-negative Staphylococci (2,257; 69.8%) were the most frequent bacteria, with Staphylococcus epidermidis (1,677; 51.9%) being the most isolated organism, followed by Pseudomonas aeruginosa (275; 8.5%) and Staphylococcus aureus (274; 8.5%). Fusarium spp. was the most common fungus. Less than 60% of S. epidermidis isolates showed susceptibility to Oxacillin, Cefazolin, Moxifloxacin, and Gentamicin, while more than 90% of isolates were susceptible to Gatifloxacin. P. aeruginosa showed less than 80% susceptibility only to Imipenem.

Conclusion

Gram-positive bacteria were the most isolated, with S. epidermidis being the most frequent pathogen, followed by P. aeruginosa. S. epidermidis exhibited alarmingly low susceptibility to commonly used antibiotics.

Resumen

Objetivo

El principal objetivo de este estudio es describir el perfil microbiológico de las úlceras corneales bacterianas y fúngicas, así como el perfil de susceptibilidad antibiótica de las especies patógenas más frecuentes.

Métodos

Se llevó a cabo un estudio descriptivo retrospectivo utilizando los datos registrados de los raspados de úlceras corneales del laboratorio de microbiología ocular del Instituto Nacional de Oftalmología. Se recolectaron e incluyeron los datos de laboratorio de 2015 a 2022 de todos los raspados de úlceras corneales.

Resultados

Tras la exclusión de muestras repetidas, no cultivadas y resultados repetidos, se obtuvo un total de 3470 muestras corneales muestreadas. Las muestras positivas representaron el 88.1% de todos los raspados. 2816 (81.2%), 904 (26.2%) y 662 (19.1%) mostraron crecimiento bacteriano, fúngico y mixto, respectivamente. Los staphylococus coagulasa negativo (2257; 69.8%) fueron las bacterias más frecuentes y dentro de ellos Staphylococcus epidermidis (1677; 51.9%) fue el organismo más aislado; seguidos de Pseudomonas aeruginosa (275; 8.5%) y Staphylococcus aureus (274; 8.5%). Fusarium spp. fue el hongo más común. Menos del 60% de los aislamientos de S. epidermidis mostraron susceptibilidad a Oxacilina, Cefazolina, Moxifloxacino y Gentamicina, mientras que más del 90% de los aislados fueron susceptibles a Gatifloxacino, P. Aeruginosa mostró menos del 80% de susceptibilidad solo para Imipenem.

Conclusión

Las bacterias grampositivas fueron las más aisladas, y S. epidermidis fue el patógeno más comúnmente aislado, seguido de P. aeruginosa. S. epidermidis mostró una preocupante baja susceptibilidad a los antibióticos de uso común.