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Molecular identification of yeasts from the order Trichosporonales causing superficial infections
Identificación molecular de levaduras del orden Trichosporonales causantes de infecciones superficiales
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Erick Martínez-Herreraa,1, Esperanza Duarte-Escalanteb,1, María del Rocío Reyes-Montesb, Roberto Arenasc, Gustavo Acosta-Altamiranoa, Gabriela Moreno-Coutiñoc, Tania Mayela Vite-Garínd, Alejandro Meza-Roblesc, María Guadalupe Frías-De-Leóna,
Autor para correspondencia
magpefrias@gmail.com

Corresponding author.
a Unidad de Investigación, Hospital Regional de Alta Especialidad de Ixtapaluca, Ixtapaluca, Edo. Méx., Mexico
b Laboratorio de Micología Molecular, Departamento de Microbiología y Parasitología, Facultad de Medicina, UNAM, Mexico
c Sección de Micología, Hospital General “Dr. Manuel Gea González”, Mexico
d Laboratorio de Inmunología de Hongos, Departamento de Microbiología y Parasitología, Facultad de Medicina, UNAM, Mexico
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Recibido 08 Junio 2020. Aceptado 18 Enero 2021
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Table 1. Isolates according to the type of infection and underlying condition of every patient.
Table 2. Identification of the studied isolates based on the BLAST analysis.
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Abstract
Background

The molecular reclassification of the order Trichosporonales placed the medically relevant Trichosporon species into three genera of the family Trichosporonaceae: Cutaneotrichosporon, Trichosporon, and Apiotrichum. From the clinical and epidemiological standpoint, it is important to identify any species of the family Trichosporonaceae because they present different antifungal susceptibility profiles. In Mexico, little is known about trichosporonosis etiology because the fungi are identified through phenotypic methods.

Aims

To identify at a molecular level 12 yeast isolates morfologically compatible with Trichosporon, obtained from patients with superficial infections.

Methods

The yeast isolates were obtained from patients with white piedra, onychomycosis, and hand and foot dermatomycosis, and were identified morphologically and genotypically (sequencing of the IGS1 region and phylogenetic analysis using the Maximum Likelihood Method). The phylogenetic analysis included 40 yeast sequences from the order Trichosporonales and one from Cryptococcus neoformans as outgroup.

Results

Based on the molecular analysis, we identified three (25%) Trichosporon inkin isolates, two (16.7%) Trichosporon asteroides, two (16.7%) Cutaneotrichosporon mucoides, and one each (8.3%) of Trichosporon aquatile, Trichosporon asahii, Apiotrichum montevideense, Cutaneotrichosporon cutaneum, and Cutaneotrichosporon jirovecii.

Conclusions

The molecular characterization of the isolates showed a broad diversity of species within the order Trichosporonales, particularly among onychomycosis. It is essential to identify these yeasts at the species level to delve into their epidemiology.

Keywords:
Trichosporon
Apiotrichum
Cutaneotrichosporon
IGS
Dermatomycosis
Resumen
Antecedentes

La reclasificación molecular del orden Trichosporonales ubicó las especies de Trichosporon de importancia médica en tres géneros en la familia Trichosporonaceae: Cutaneotrichosporon, Trichosporon y Apiotrichum. Desde la perspectiva clínica y epidemiológica es importante la identificación de las especies dentro de la familia Trichosporonaceae debido a sus diferentes perfiles de sensibilidad a los antifúngicos. En México, la etiología de la trichosporonosis es poco conocida porque los hongos son identificados por métodos fenotípicos.

Objetivos

Identificar molecularmente 12 aislamientos de levaduras, morfológicamente compatibles con el género Trichosporon, recuperados de pacientes con infección superficial.

Métodos

Los 12 aislamientos, procedentes de pacientes con piedra blanca, onicomicosis y dermatomicosis de las manos y los pies, fueron identificados morfológica y genotípicamente (secuenciación de la región IGS1 y análisis filogenético con el método de máxima verosimilitud). En el análisis filogenético se incluyeron 40 secuencias de levaduras del orden Trichosporonales y una de Cryptococcus neoformans como grupo externo.

Resultados

En base al análisis molecular se identificaron tres (25%) aislamientos de Trichosporon inkin, dos (16,7%) de Trichosporon asteroides, dos (16,7%) de Cutaneotrichosporon mucoides y uno (8,3%) de cada una de las siguientes especies: Trichosporon aquatile, Trichosporon asahii, Apiotrichum montevideense, Cutaneotrichosporon cutaneum y Cutaneotrichosporon jirovecii.

Conclusiones

La caracterización molecular de los aislamientos mostró una diversidad de especies dentro del orden Trichosporonales, especialmente en las onicomicosis. Es importante identificar estas levaduras a nivel de especie para profundizar en su epidemiología.

Palabras clave:
Trichosporon
Apiotrichum
Cutaneotrichosporon
IGS
Dermatomicosis

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