Molecular identification of yeasts from the order Trichosporonales causing superficial infections

Abstract

Background

The molecular reclassification of the order Trichosporonales placed the medically relevant Trichosporon species into three genera of the family Trichosporonaceae: Cutaneotrichosporon, Trichosporon, and Apiotrichum. From the clinical and epidemiological standpoint, it is important to identify any species of the family Trichosporonaceae because they present different antifungal susceptibility profiles. In Mexico, little is known about trichosporonosis etiology because the fungi are identified through phenotypic methods.

Aims

To identify at a molecular level 12 yeast isolates morfologically compatible with Trichosporon, obtained from patients with superficial infections.

Methods

The yeast isolates were obtained from patients with white piedra, onychomycosis, and hand and foot dermatomycosis, and were identified morphologically and genotypically (sequencing of the IGS1 region and phylogenetic analysis using the Maximum Likelihood Method). The phylogenetic analysis included 40 yeast sequences from the order Trichosporonales and one from Cryptococcus neoformans as outgroup.

Results

Based on the molecular analysis, we identified three (25%) Trichosporon inkin isolates, two (16.7%) Trichosporon asteroides, two (16.7%) Cutaneotrichosporon mucoides, and one each (8.3%) of Trichosporon aquatile, Trichosporon asahii, Apiotrichum montevideense, Cutaneotrichosporon cutaneum, and Cutaneotrichosporon jirovecii.

Conclusions

The molecular characterization of the isolates showed a broad diversity of species within the order Trichosporonales, particularly among onychomycosis. It is essential to identify these yeasts at the species level to delve into their epidemiology.

Resumen

Antecedentes

La reclasificación molecular del orden Trichosporonales ubicó las especies de Trichosporon de importancia médica en tres géneros en la familia Trichosporonaceae: Cutaneotrichosporon, Trichosporon y Apiotrichum. Desde la perspectiva clínica y epidemiológica es importante la identificación de las especies dentro de la familia Trichosporonaceae debido a sus diferentes perfiles de sensibilidad a los antifúngicos. En México, la etiología de la trichosporonosis es poco conocida porque los hongos son identificados por métodos fenotípicos.

Objetivos

Identificar molecularmente 12 aislamientos de levaduras, morfológicamente compatibles con el género Trichosporon, recuperados de pacientes con infección superficial.

Métodos

Los 12 aislamientos, procedentes de pacientes con piedra blanca, onicomicosis y dermatomicosis de las manos y los pies, fueron identificados morfológica y genotípicamente (secuenciación de la región IGS1 y análisis filogenético con el método de máxima verosimilitud). En el análisis filogenético se incluyeron 40 secuencias de levaduras del orden Trichosporonales y una de Cryptococcus neoformans como grupo externo.

Resultados

En base al análisis molecular se identificaron tres (25%) aislamientos de Trichosporon inkin, dos (16,7%) de Trichosporon asteroides, dos (16,7%) de Cutaneotrichosporon mucoides y uno (8,3%) de cada una de las siguientes especies: Trichosporon aquatile, Trichosporon asahii, Apiotrichum montevideense, Cutaneotrichosporon cutaneum y Cutaneotrichosporon jirovecii.

Conclusiones

La caracterización molecular de los aislamientos mostró una diversidad de especies dentro del orden Trichosporonales, especialmente en las onicomicosis. Es importante identificar estas levaduras a nivel de especie para profundizar en su epidemiología.