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Disponible online el 9 de Febrero de 2021
Evaluación clínica de un nuevo método molecular para la detección de microorganismos multirresistentes
Clinical evaluation of a new molecular method for the detection of multidrug-resistant microorganisms
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Alba de la Rica-Martíneza, María Andres-Francha, Gabriel Estan-Cerezob, Montserrat Ruiz-Garciaa, Juan Carlos Rodríguez-Díazc, Nieves Gonzalo-Jimeneza, Antonio Galiana-Cabreraa,
Autor para correspondencia
antoniogaliana1@gmail.com

Autor para correspondencia.
a Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
b Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
c Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Alicante, Instituto de Investigación Sanitaria y Biomédica de Alicante (ISABIAL), Alicante, España
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Tabla 1. Determinantes genéticos de resistencia detectados mediante el ensayo con el kit AMR Direct Flow Chip®
Tabla 2. Sensibilidad y especificidad para los ensayos realizados empleando el kit AMR Direct Flow Chip® en hisopos nasales y rectales para la detección de determinantes genéticos de resistencia
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Material adicional (1)
Resumen
Introducción

El objetivo fue realizar la validación clínica del sistema molecular AMR Direct Flow Chip® para la detección de genes de resistencia a antimicrobianos partiendo de aislados bacterianos en cultivo, así como de hisopos de muestras nasales o rectales.

Métodos

El ensayo AMR es una PCR multiplex seguida de hibridación reversa tipo dot blot en arrays de ADN completamente automatizada mediante la plataforma HS24, con un tiempo de realización de 3h. Se realizó la validación preclínica con 104 cepas bacterianas caracterizadas y posteriormente se analizaron 210 muestras de hisopos nasales o rectales.

Resultados

La sensibilidad y la especificidad del ensayo preclínico fueron del 100%, identificando correctamente las 104 cepas. En la validación clínica, la sensibilidad fue del 100% y la especificidad fue del 100% en muestras rectales y del 97% en hisopos nasales.

Conclusiones

El sistema AMR Direct Flow Chip® es un sistema rápido y eficaz para la detección de microorganismos multirresistentes a partir de muestras rectales y nasales.

Palabras clave:
Técnicas de diagnóstico molecular
Multirresistencia a fármacos en español
Análisis de microarrays
Epidemiología molecular
Abstract
Introduction

The main objective of this work is to carry out the clinical validation of the trial with the AMR Direct Flow Chip® starting from either nasal swabs, rectal swabs directly or from isolated strains to detect antibiotic resistance genes.

Methods

We developed the preclinical validation of the assay with 104 known bacterial isolates. A total of 210 nasal or rectal swab samples were analyzed. The AMR assay is based on multiplex PCR followed by reverse dot blot hybridization on DNA arrays fully automated by using the HS24 platform. The completion time of the full analysis is 3 hours.

Results

Both the sensitivity and specificity of the preclinical assay were 100%, with the 104 samples correctly identified. In the clinical validation, the sensitivity was 100% and the specificity was between 100% in rectal swabs and 97% in nasal swabs.

Conclusions

The AMR Direct Flow Chip® is a rapid and effective assay for the detection of multidrug-resistant microorganisms from nasal and rectal swab samples.

Keywords:
Molecular diagnostic techniques
Multiple drug resistance en inglés
Microarray analysis
Molecular epidemiology

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