Antimicrobial resistance patterns of Nocardia species in clinical isolates from Argentina (2020–2022)

Abstract

Introduction

Nocardia species are opportunistic pathogens with intrinsic antimicrobial resistance and regional variability in susceptibility patterns. Argentina lacks standardized surveillance data, complicating empirical therapy. This study aimed to characterize Nocardia species distribution and antimicrobial resistance profiles nationwide.

Methods

We analyzed 62 clinical Nocardia isolates from 41 laboratories across eight Argentine provinces (2020–2022). Species identification utilized MALDI-TOF mass spectrometry. Antimicrobial susceptibility testing was performed via broth microdilution for 11 antibiotics according to CLSI guidelines, with additional E-test comparisons.

Results

Respiratory specimens predominated (67.7%), followed by central nervous system (14.5%), skin/soft tissue (8.1%), and bloodstream (6.5%) infections. Primary species identified were N. cyriacigeorgica (30.6%), N. abscessus complex (22.6%), and N. farcinica complex (17.7%). Highest susceptibility rates occurred with linezolid (100%) and trimethoprim–sulfamethoxazole (97.6%). Significant resistance was observed for clarithromycin (81.0%), ciprofloxacin (76.2%), and moxifloxacin (57.1%). N. farcinica dominated CNS infections (55.6%), while N. brasiliensis complex prevailed in skin/soft tissue cases (80%). Methodological discrepancies between testing methods showed 33.3% major errors for ceftriaxone (E-test vs. microdilution).

Conclusion

This first Argentine nationwide surveillance study confirms trimethoprim–sulfamethoxazole and linezolid as reliable empiric therapy options while highlighting concerning resistance to fluoroquinolones and macrolides. The observed methodological discordance emphasizes the critical need for standardized antimicrobial susceptibility testing protocols for Nocardia species.

Resumen

Introducción

Las especies de Nocardia son patógenos oportunistas con resistencia antimicrobiana intrínseca y variabilidad regional en los patrones de sensibilidad. Argentina carece de datos de vigilancia estandarizados, lo que complica la terapia empírica. Este estudio tuvo como objetivo caracterizar la distribución de especies de Nocardia y sus perfiles de resistencia antimicrobiana a nivel nacional.

Métodos

Analizamos 62 aislados clínicos de Nocardia provenientes de 41 laboratorios en 8 provincias argentinas (2020-2022). La identificación de especies se realizó mediante espectrometría de masas MALDI-TOF. Las pruebas de sensibilidad antimicrobiana se efectuaron por microdilución en caldo para 11 antibióticos según directrices del CLSI, con comparaciones adicionales por E-test.

Resultados

Predominaron muestras respiratorias (67,7%), seguidas por infecciones del sistema nervioso central (14,5%), piel/tejidos blandos (8,1%) y sangre (6,5%). Las principales especies identificadas fueron N. cyriacigeorgica (30,6%), complejo N. abscessus (22,6%) y complejo N. farcinica (17,7%). Las mayores tasas de sensibilidad ocurrieron con linezolid (100%) y trimetoprima-sulfametoxazol (97,6%). Se observó resistencia significativa para claritromicina (81,0%), ciprofloxacina (76,2%) y moxifloxacina (57,1%). N. farcinica dominó en infecciones del SNC (55,6%), mientras el complejo N. brasiliensis prevaleció en casos de piel y partes blandas (80%). Las discrepancias metodológicas entre técnicas de prueba mostraron un 33,3% de errores mayores para ceftriaxona (E-test vs. microdilución).

Conclusión

Este primer estudio de vigilancia nacional argentino confirma trimetoprima-sulfametoxazol y linezolid como opciones confiables para terapia empírica, destacando una preocupante resistencia a fluoroquinolonas y macrólidos. La discordancia metodológica observada enfatiza la necesidad crítica de protocolos estandarizados de pruebas de sensibilidad antimicrobiana para especies de Nocardia.