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RDRioMycobacterium tuberculosis strains associated with isoniazid resistance in Northern Mexico
Identificación del genotipo Mycobacterium tuberculosis RDRio en el norte de México y su asociación con la resistencia a isoniazida
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Virgilio Bocanegra-Garcíaa, Luis Jesús Cortez-de-la-Fuenteb, Yuko Nakamura-Lópezc, Gloria María Gonzálezb, Gildardo Riveraa, José Prisco Palma-Nicolásb,
Autor para correspondencia
a Instituto Politécnico Nacional, Centro de Biotecnología Genómica, Laboratorio Interacción ambiente-microorganismo, Reynosa, Tamaulipas, Mexico
b Universidad Autónoma de Nuevo León, Facultad de Medicina y Hospital Universitario Dr. José Eleuterio González, Departamento de Microbiología, Monterrey N.L., Mexico
c Consejo Estatal para la Prevención y Control del Sida, Laboratorio de Biología Molecular, San Bartolo Coyotepec, Oaxaca, Mexico
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Recibido 14 marzo 2020. Aceptado 06 julio 2020
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Table 1. Main genetic lineages of Mycobacterium tuberculosis and their association with drug-resistance to first-line drugs.
Table 2. First-line drug susceptibility of Mycobacterium tuberculosis RDRio and ill-defined T strains.
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Abstract
Background

It has been established that the genomic background of Mycobacterium tuberculosis may influence disease progression, in particular for the Beijing family and the Latin American and Mediterranean (LAM)/RDRio strains. The purpose of this study was to evaluate the prevalence of the LAM/RDRio genotype in cases of tuberculosis from Mexico and their drug susceptibility profile.

Methods

Two hundred eighteen M. tuberculosis isolates were screened by 43-spacer spoligotyping. The LAM/RDRio genotype was confirmed by multiplex PCR, and the drug susceptibility testing was carried out in solid Löwenstein-Jensen media.

Results

Among the LAM strains identified, 24 (63.1%) were confirmed as M. tuberculosis RDRio. All RDRio strains shared the RD174 deletion, that was associated with isoniazid resistance (p=0.0264).

Conclusions

We documented for the first time the isolation of the LAM/RDRio genotype in pulmonary cases of tuberculosis in Mexico, and we found resistance to the first-line anti-tuberculosis drug isoniazid in these strains.

Keywords:
Tuberculosis
Beijing
RDRio
SIT163
Isonizid
Resumen
Introducción

El genotipo de Mycobacteriumtuberculosis podría influir en la fisiopatología y la evolución de la tuberculosis, en particular los genotipos Beijing y LAM/RDRio. El propósito de este estudio fue evaluar la prevalencia del genotipo LAM/RDRio en casos de tuberculosis pulmonar en México y determinar su perfil de sensibilidad a los fármacos antituberculosos.

Métodos

Se evaluaron 218 cepas de M. tuberculosis mediante spoligotyping. El genotipo LAM/RDRio se confirmó mediante PCR múltiple. Las pruebas de sensibilidad a fármacos antituberculosos se realizaron en medio sólido de Löwenstein-Jensen.

Resultados

Entre las cepas LAM identificadas, 24 (63,1%) fueron confirmadas como M. tuberculosis RDRio y se asociaron significativamente con resistencia a isoniazida (p = 0,0264). Todos los aislamientos RDRio presentaron la deleción del locus RD174.

Conclusión

En este estudio documentamos por primera vez el aislamiento del genotipo RDRio en casos de tuberculosis pulmonar en México, encontrando una asociación estadísticamente significativa entre este genotipo y la resistencia a isoniazida.

Palabras clave:
Tuberculosis
Beijing
RDRio
SIT63
Isoniazida

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