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Population structure of Neisseria meningitidis ST-9493 identified in Colombian isolates
Estructura poblacional de Neisseria meningitidis ST-9493 identificada en aislamientos colombianos
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Zonia Katerin Alarcona, Diego Pradaa, Jean Marc Gabastoub, Olga Sanabriaa, Carolina Duartea, Jaime Morenoa,
Autor para correspondencia
jmoreno@ins.gov.co

Corresponding author.
a Grupo de Microbiología, Instituto Nacional de Salud (INS), Bogotá, Colombia
b Panamerican Health Organization/World Health Organization (PAHO/WHO)
Este artículo ha recibido
Recibido 14 octubre 2021. Aceptado 26 enero 2022
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Abstract
Introduction

Neisseria meningitidis is associated with invasive infections causing high mortality rates. The objective of this study was to describe the population structure of Colombian invasive isolates with ST-9493, a potentially emerging clonal group in the country.

Methods

The complete genomes of 34 invasive isolates of serogroup B with ST-9493 and its variants at one or two loci were sequenced by Illumina to describe the phenotypic and genotypic characteristics of these isolates.

Results

The relationship of a clonal group associated with ST-136 CC41/44 was phylogenetically established, identifying two main clades composed of isolates from an outbreak or endemic. The most frequent alleles and peptides included porA 17, porB 44, fHbp 2.24, NHBA 10, and the FetA F5-17 variant. Most of the isolates were susceptible to the antibiotics evaluated.

Conclusion

This study shows that meningococcal isolates with ST-9493 are an autochthonous clonal group with population dynamics and the capacity to cause endemic and epidemic meningococcal disease in Colombia.

Keywords:
Neisseria meningitidis
Serogroup B
Clone
Whole genome sequencing
Multilocus sequence typing
Resumen
Introducción

Neisseria meningitidis se asocia con infecciones invasivas que causan altas tasas de mortalidad. El objetivo de este estudio fue describir la estructura poblacional de aislamientos invasivos colombianos con ST-9493, un grupo clonal potencialmente emergente en el país.

Métodos

Se secuenció por Illumina el genoma completo de 34 aislamientos invasivos, serogrupo B con ST-9493 y sus variantes en uno o doble locus para describir sus características fenotípicas y genotípicas.

Resultados

Se estableció filogenéticamente la relación como grupo clonal asociado con el ST-136 CC41/44, identificando 2 clados principales conformados por aislamientos de un brote o endémicos. Los alelos y péptidos más frecuentes fueron porA 17 y porB 44; fHbp 2.24, NHBA 10 y la variante FetA F5-17. La mayoría de los aislamientos fueron susceptibles a los antibióticos evaluados.

Conclusión

Este estudio muestra que los aislamientos meningocócicos con ST-9493 son un grupo clonal autóctono con dinámica poblacional y capacidad de causar enfermedad meningocócica endémica y epidémica en Colombia.

Palabras clave:
Neisseria meningitidis
Serogrupo B
Clon
Secuenciación de genoma completo
Tipificación multilocus de secuencias

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