Evaluation of a mass spectrometry and Vitek 2 combined protocol for rapid identification and susceptibility testing of Enterobacterales directly from positive blood cultures

Abstract

Objective

The aim was to evaluate a rapid method which would combine identification and susceptibility testing directly from positive blood cultures for Gram-negative bacilli of the Enterobacterales.

Material and methods

Gram-negative rods from blood cultures were directly identified by MALDI-TOF. Samples with Enterobacterales were selected for direct antimicrobial susceptibility testing by Vitek 2. The results were compared to those obtained with our laboratory's standard method.

Results

MALDI-TOF directly from blood cultures identified correctly 83% of the samples. Enterobacterales (n = 68) were identified at gender and species level in 85% of blood cultures with a score >1.7. In general, MICs were obtained after 7 h. MICs of amoxicillin-clavulanate, amikacin and ciprofloxacin showed in almost 50% of the cases after 5 h.

Conclusions

A simple procedure with low cost and reduced working time makes it possible to integrate both identification and susceptibility testing directly from blood cultures. Thus, this protocol could offer advantages when it comes to selection and cost of treatment and patients’ clinical outcomes.

Resumen

Objetivo

Evaluar un método rápido de identificación y estudio de sensibilidad directamente desde hemocultivos positivos para bacilos gramnegativos del orden Enterobacterales.

Material y métodos

Los hemocultivos con bacilos gramnegativos fueron utilizados para identificación mediante MALDI-TOF, seleccionándose aquellos con Enterobacterales para estudio de sensibilidad con Vitek 2. Los resultados fueron comparados con el método estándar del laboratorio.

Resultados

MALDI-TOF identificó correctamente el 83% de las muestras obtenidas directamente de hemocultivos. En caso de Enterobacterales (n = 68), el 85% se identificaron a nivel de género y especie con un score > 1,7. El tiempo necesario para la obtención de CMIs fue de 7 horas, reduciéndose a 5 en amoxicilina-clavulánico, amicacina y ciprofloxacino, casi en el 50% de los casos.

Conclusiones

Un protocolo simplificado, con bajo coste y reducido tiempo de trabajo, combinando identificación y estudio de sensibilidad directamente desde hemocultivos, podría proporcionar beneficios en la elección y coste del tratamiento, y mejora clínica del paciente.