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Utilidad del PCR multiplex en el diagnóstico microbiológico temprano y adecuación antimicrobiana en pacientes críticos con bacteriemias

Utility of multiplex PCR for early microbiological diagnosis and antimicrobial optimization in critically ill patients with bacteremia
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Nahuel Hernándeza, Sofia Mauroa, Santiago Munillab, Mariela Vieytesb, Antonio Galianab, Marcelo Barbatoa, Federico Vergaa,
Autor para correspondencia
vergafederico@gmail.com

Autor para correspondencia.
a Unidad de Cuidados Intensivos, Hospital Maciel, Administración de los Servicios de Salud del Estado (ASSE), Montevideo, Uruguay
b Servicio de Laboratorio de Microbiología y Biología Molecular-UDYCI, Hospital Maciel, Administración de los Servicios de Salud del Estado (ASSE), Montevideo, Uruguay
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Resumen
Introducción

Las bacteriemias constituyen una de las principales infecciones en pacientes críticos. La instauración precoz y adecuada de antibioticoterapia es un factor clave para la reducción de la mortalidad.

Objetivos

Evaluar la utilidad del PCR multiplex BioFire® Blood Culture Identification de segunda generación (BCID2) en identificación microbiológica y adecuación de la antibioticoterapia en pacientes críticos con bacteriemia, en comparación con microbiología convencional.

Métodos

Estudio descriptivo, retrospectivo y observacional, realizado en la UCI del Hospital Maciel, centro de tercer nivel perteneciente a la Administración de Servicios de Salud del Estado (ASSE), Montevideo, Uruguay. En el período 1 de enero al 31 de diciembre de 2023 se incluyeron pacientes ingresados en la UCI que desarrollaron bacteriemia y se realizó BCID2. Se compararon resultados del BCID2 con los hemocultivos convencionales, determinándose el porcentaje de concordancia positiva (PCP) y negativa (PCN) tanto para la identificación microbiológica como para mecanismos de resistencia.

Resultados

Se incluyeron 50 pacientes con hemocultivos positivos en los que se realizó PCR. El BCID2 detectó 64 microorganismos y 26 mecanismos de resistencia. En cuanto a la identificación microbiológica, el BCID2 mostró PCP del 98,3% (IC 95%: 91-100) y PCN del 99,5% (IC 95%: 99-100) en comparación con métodos convencionales. Respecto a la detección de resistencia, la concordancia para la presencia o ausencia de mecanismos de resistencia fue del 93%, con discordancia del 7% entre ambos métodos. A partir de los resultados del BCID2 se realizó una modificación efectiva de la antibioticoterapia en el 50% de los casos.

Conclusiones

En pacientes críticos con bacteriemia, la utilización del BCID2 permite una identificación microbiológica rápida y precisa, favoreciendo la optimización temprana del tratamiento antiinfeccioso.

Palabras clave:
Bacteriemias
Métodos de detección molecular
Panel PCR multiplex
Diagnóstico microbiológico rápido
Cuidados críticos
Abstract
Introduction

Bacteremia is one of the most frequent infections in critically ill patients. Early and appropriate antimicrobial therapy is a key factor in reducing mortality.

Objectives

To evaluate the usefulness of the second-generation BioFire® Blood Culture Identification multiplex PCR panel (BCID2) for microbiological identification and antimicrobial therapy optimization in critically ill patients with bacteremia, compared with conventional microbiology methods.

Methods

A descriptive, retrospective, observational study was conducted in the Intensive Care Unit of Hospital Maciel, a tertiary-level center belonging to the State Health Services Administration (ASSE), Montevideo, Uruguay. Patients admitted to the ICU who developed bacteremia and underwent BCID2 testing between January 1 and December 31, 2023, were included. BCID2 results were compared with conventional blood culture results, and positive and negative percent agreement (PPA and NPA) were calculated for microbiological identification and resistance mechanisms.

Results

Fifty patients with positive blood cultures who underwent PCR testing were included. BCID2 detected 64 microorganisms and 26 resistance mechanisms. Regarding microbiological identification, BCID2 showed a PPA of 98.3% (95% CI: 91–100) and an NPA of 99.5% (95% CI: 99–100) compared with conventional microbiological methods. Concerning antimicrobial resistance, concordance for the presence or absence of resistance mechanisms was 93%, with a 7% discordance between both methods. Based on BCID2 results, antimicrobial therapy was effectively modified in 50% of cases.

Conclusions

In critically ill patients with bacteremia, the use of BCID2 enables rapid and accurate microbiological identification, facilitating early optimization of antimicrobial therapy.

Keywords:
Bacteremia
Molecular detection method
Multiplex PCR panel
Rapid microbiological diagnosis
Critical care

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