Buscar en
Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (English Edition)
Toda la web
Inicio Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (English Edition)
Journal Information
Share
Share
Download PDF
More article options
ePub
Visits
...
Original article
DOI: 10.1016/j.eimce.2019.08.006
Field performance of the Abbott RealTime MTB assay for the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis in a low-prevalence setting
Rendimiento del ensayo Abbott RealTime MTB para el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar en un entorno de baja prevalencia
Visits
...
Rafael Borrása,b, Víctor Martíneza, Víctor Vinuesaa, Ignacio Torresa, Nieves Ortac, María Ángeles Claric, Josep Pratd, David Navarroa,b,
Corresponding author
david.navarro@uv.es

Corresponding author.
a Microbiology Service, Hospital Clínico Universitario, Instituto de Investigación INCLIVA, Valencia, Spain
b Department of Microbiology, School of Medicine, University of Valencia, Valencia, Spain
c Microbiology Unit, Hospital Francisco de Borja, Gandía, Spain
d Microbiology Unit, Hospital de Sagunto, Spain
Article information
Abstract
Full Text
Bibliography
Download PDF
Statistics
Figures (1)
Tables (3)
Table 1. Performance of the Abbott Real Time MTB assay in comparison with and culture for Mycobacterium tuberculosis complex in organ or tissue-derived specimens.
Table 2. Performance of the Abbott Real Time MTB assay in comparison with and culture for Mycobacterium tuberculosis complex in sterile and non-sterile fluids.
Table 3. Demographic, clinical, and microbiological data of patients who tested positive with the Abbott Real Time MTB PCR and negative by culture for Mycobacterium tuberculosis complex.
Show moreShow less
Abstract
Introduction

The sensitivities of conventional mycobacterial culture in solid or liquid media and acid-fast bacilli (AFB) smear microscopy for Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) detection in extrapulmonary specimens are suboptimal. We evaluated the field performance of the Abbott RealTime MTB assay for the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis in a low-prevalence setting.

Methods

The total number of extrapulmonary specimens with mycobacterial culture and PCR results was 566: sterile fluids (n=278), non-sterile fluids (n=147), lymph node material (n=69) tissue biopsies (n=63), and abscess aspirates (n=9). A composite standard consisting of mycobacterial culture results, clinical treatment response to anti-TB drugs, when administered, and histopathology, radiological and laboratory findings were used as a reference for sensitivity and specificity calculations.

Results

Mycobacterial cultures and PCR were positive in 17 and 28 specimens, respectively. The overall agreement between culture and PCR was moderate (Cohen's kappa coefficient: 0.549; P=0.0001). Taking as a reference our composite standard, the sensitivity of the Abbott PCR assay was 77.7%, the specificity 99.5%, the PPV 95.4%, and the NPV 98.8%. In turn, the sensitivity of the mycobacterial culture was 62.9%, the specificity and PPV 100%, and the NPV 97.9%.

Conclusion

The good field performance of the Abbott RealTime MTB assay makes it valuable for the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis in a low-prevalence setting. The use of molecular methods along with culture improves the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis.

Keywords:
Tuberculosis
Mycobacterium tuberculosis complex
Real-time polymerase chain reaction
Extrapulmonary tuberculosis
Field study
Resumen
Introducción

La sensibilidad del cultivo convencional de micobacterias en medios sólidos o líquidos y la de la microscopía de bacilos ácido-alcohol resistentes para detectar el complejo Mycobacterium tuberculosis en muestras extrapulmonares es subóptima. Evaluamos el rendimiento del ensayo Abbott RealTime MTB para el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar en un entorno de baja prevalencia.

Métodos

El número total de muestras extrapulmonares con cultivo de micobacterias y resultados de la reacción en cadena de la polimerasa fue de 566: líquidos estériles (n=278), líquidos no estériles (n=147), material de los ganglios linfáticos (n=69), biopsias de tejido (n=63) y aspiraciones de abscesos (n=9). Para calcular la sensibilidad y la especificidad del ensayo se utilizó como referencia un parámetro que incluyó: resultados del cultivo, respuesta clínica al tratamiento con antituberculosos y hallazgos de laboratorio, radiológicos e histopatológicos.

Resultados

Los cultivos de micobacterias y la PCR fueron positivos en 17 y 28 muestras, respectivamente. La concordancia de los resultados obtenidos por ambos métodos fue moderada (coeficiente kappa de Cohen: 0,549; p=0,0001). La sensibilidad de la PCR de Abbott fue del 77,7%, especificidad del 99,5 %, valor predictivo positivo del 95,4% y valor predictivo negativo del 98,8%. La sensibilidad del cultivo fue del 62,9%, la especificidad y el valor predictivo positivo del 100% y el valor predictivo negativo del 97,9%.

Conclusión

El buen rendimiento del ensayo Abbott RealTime MTB lo hace valioso para el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar en un entorno de baja prevalencia. El uso de métodos moleculares junto al cultivo mejora el diagnóstico de la tuberculosis extrapulmonar.

Palabras clave:
Tuberculosis
Complejo Mycobacterium tuberculosis
Reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real
Tuberculosis extrapulmonar
Estudio de campo

Article

These are the options to access the full texts of the publication Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (English Edition)
Member

Socio de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica

Para acceder a la revista

Es necesario que lo haga desde la zona privada de la web de la SEIMC, clique aquí

Para realizar los cursos formativos

La actividad estará abierta para socios de la SEIMC. IMPORTANTE, recuerde que requiere registro previo gratuito. Empezar aquí

Subscriber
Subscriber

If you already have your login data, please click here .

If you have forgotten your password you can you can recover it by clicking here and selecting the option “I have forgotten my password”
Subscribe
Subscribe to

Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (English Edition)

Purchase
Purchase article

Purchasing article the PDF version will be downloaded

Price 19.34 €

Purchase now
Contact
Phone for subscriptions and reporting of errors
From Monday to Friday from 9 a.m. to 6 p.m. (GMT + 1) except for the months of July and August which will be from 9 a.m. to 3 p.m.
Calls from Spain
932 415 960
Calls from outside Spain
+34 932 415 960
E-mail
es en pt

¿Es usted profesional sanitario apto para prescribir o dispensar medicamentos?

Are you a health professional able to prescribe or dispense drugs?

Você é um profissional de saúde habilitado a prescrever ou dispensar medicamentos