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Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (English Edition)
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Continuing medical education: Methods of rapid diagnosis
DOI: 10.1016/j.eimce.2017.03.023
Molecular methods for septicemia diagnosis
Métodos moleculares para el diagnóstico de septicemia
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Francesc Marcoa,b
a Servicio de Microbiología, Centro de Diagnóstico Biomédico, Hospital Clínic, Barcelona, Spain
b ISGlobal, Barcelona Institute for Global Health, Hospital Clínic-Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain
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Septicemia remains a major cause of hospital mortality. Blood culture remains the best approach to identify the etiological microorganisms when a bloodstream infection is suspected but it takes long time because it relies on bacterial or fungal growth. The introduction in clinical microbiology laboratories of the matrix-assisted laser desorption ionisation time-of-flight mass spectrometry technology, DNA hybridisation, microarrays or rapid PCR-based test significantly reduce the time to results. Tests for direct detection in whole blood samples are highly desirable because of their potential to identify bloodstream pathogens without waiting for blood cultures to become positive. Nonetheless, limitations of current molecular diagnostic methods are substantial. This article reviews these new molecular approaches (LightCycler SeptiFast, Magicplex sepsis real time, Septitest, VYOO, PCR/ESI-MS analysis, T2Candida).

Keywords:
Sepsis
Molecular diagnostics
Rapid diagnostics
Resumen

La septicemia es una de las causas más importantes de muerte en pacientes hospitalizados. El hemocultivo es el método de referencia para detectar el agente etiológico responsable, pero el resultado definitivo depende de la velocidad de crecimiento del microorganismo. En los últimos años el empleo de diversas tecnologías como la espectrometría de masas (matrix-assisted laser desoption ionization time-of-flight), la hibridación del ADN, los microarrays o las reacciones de PCR rápidas han disminuido de forma considerable el tiempo necesario para la identificación de los microorganismos y la detección de genes de resistencia a partir de hemocultivos positivos. El diagnóstico molecular de una septicemia directamente de la sangre del paciente permite conocer el resultado en pocas horas, aunque todavía existen diversas limitaciones que dificultan su empleo. En esta revisión se exponen los diversos métodos moleculares disponibles (LightCycler SeptiFast, Magicplex sepsis real time, Septitest, VYOO, PCR/ESI-MS análisis, T2Candida) y su posible utilidad.

Palabras clave:
Septicemia
Diagnóstico molecular
Diagnóstico rápido

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