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Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (English Edition)
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Vol. 40. Issue 4.
Pages 158-165 (April 2022)
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Vol. 40. Issue 4.
Pages 158-165 (April 2022)
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Bacterial/fungal infection in hospitalized patients with COVID-19 in a tertiary hospital in the Community of Castilla y León, Spain
Infección bacteriana/fúngica en pacientes con COVID-19 ingresados en un hospital de tercer nivel de Castilla y León, España
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Teresa Nebreda-Mayorala,
Corresponding author
tnebreda@saludcastillayleon.es

Corresponding author.
, María Antonia Miguel-Gómeza, Gabriel Alberto March-Rossellóa, Lucía Puente-Fuertesa, Elena Cantón-Benitoa, Ana María Martínez-Garcíaa, Ana Belén Muñoz-Martínb, Antonio Orduña-Domingoa
a Servicio de Microbiología e Inmunología, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, Valladolid, Spain
b Servicio de Farmacia, Hospital Clínico Universitario de Valladolid, Valladolid, Spain
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Rafael Zaragoza Crespo, Héctor Hernández-Garcés
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Tables (4)
Table 1. Demographic, clinical and microbiological characteristics of patients with COVID-19 and bacterial or fungal infection.
Table 2. Predictive factors for admission to the ICU of patients with COVID-19 and bacterial/fungal infection. Multivariate regression model.
Table 3. Aetiological agents, resistance mechanisms and analytical values in bacterial or fungal coinfections and superinfections in patients with COVID-19.
Table 4. Predictors of mortality in patients with COVID-19 and bacterial/fungal infection. Multivariate regression model.
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Abstract
Introduction

Bacterial/fungal coinfection and superinfections contribute to the increased morbi-mortality of viral respiratory infections (RIs). The main objective of this study was to determine the incidence of these infections in hospitalized patients with COVID-19.

Method

Retrospective observational study of all patients admitted for COVID-19 and bacterial/fungal infections at the Hospital Clínico Universitario of Valladolid, Spain (March 1–May 31, 2020). Demographic, clinical and microbiological data were compared based on Intensive Care Unit (ICU) admission and predictors of mortality by were identified using multivariate logistic regression analyses.

Results

Of the 712 COVID-19 patients, 113 (16%) presented bacterial/fungal coinfections or superinfections. Their median age was 73 years (IQR 57−89) and 59% were men. The profiles of ICU patients (44%) included male, SARS-CoV-2 pneumonia, leukocytosis, elevated inteleukin-6, with interferon β-1b and tocilizumab and superinfection (p < 0.05). Coinfections were diagnosed in 5% (39/712) patients. Most common pathogens of respiratory coinfection (18) were Streptococcus pneumoniae (6) and Staphylococcus aureus (6). Superinfections were detected in 11% (80/712) patients. Urinary (53) and RI (39) constituted the majority of superinfections Acinetobacter baumannii multidrug-resistant was the main agent of IR and bacteremia. An outbreak of A. baumannii contributed to this result. Three patients were considered to have probable pulmonary aspergillosis. Mortality was higher in UCI patients (50% vs. 29%, p = 0.028). The predictive factors of mortality included being a male with various comorbidities, SARS-CoV-2 pneumonia, bacteremia and superinfections from A. baumannii.

Conclusion

The outbreak of A. baumannii was a determining factor in the increases of the incidence of infection and the morbi-mortality of ICU patients.

Keywords:
COVID-19
SARS-CoV-2
Coinfection
Superinfections
Outbreak
Acinetobacter baumanniia
Resumen
Introducción

La coinfección/sobreinfección bacteriana/fúngica contribuye al incremento de la morbi-mortalidad de las infecciones respiratorias (IRs) virales. El objetivo de este trabajo es conocer la incidencia de estas infecciones en los pacientes hospitalizados por COVID-19.

Método

Estudio retrospectivo observacional de todos los pacientes ingresados por COVID-19 e infección bacteriana/fúngica en el Hospital Clínico de Valladolid (1 marzo–31 mayo, 2020). Comparación de datos demográficos, clínicos y microbiológicos en función del ingreso en UCI e identificación de los factores predictores de mortalidad mediante regresión logística multivariante.

Resultados

De 712 pacientes con COVID-19, 113 (16%) presentaron coinfección/sobreinfección bacteriana/fúngica. Mediana de edad 73 años (RIQ 57−89) y 59% de hombres. Perfil del paciente de UCI (44%): hombre con neumonía por SARS-CoV-2, leucocitosis, inteleuquina-6 elevada, con interferónβ-1b y tocilizumab y sobreinfección (p < 0,05). El 5% (39/712) de los pacientes presentaron una coinfección. Streptococcus pneumoniae (6) y Staphylococcus aureus (6) fueron los principales patógenos de las coinfecciones respiratorias (18) El 11% (80/712) se sobreinfectaron. Las infecciones más frecuentes fueron las urinarias (53) e IR (39). Acinetobacter baumannii multirresistente fue el principal agente de las IR y bacteriemias. Un brote por A. baumannii contribuyó a este resultado. Tres pacientes se diagnosticaron como probable aspergilosis pulmonar. La mortalidad fue superior en los pacientes de UCI (50% vs 29%, p = 0,028). Factores predictores de mortalidad: hombre con varias comorbilidades, neumonía por SARS-CoV-2, bacteriemia y sobreinfectado por A. baumannii.

Conclusión

El brote por A. baumannii fue determinante en la incidencia de la infección y en la morbi-mortalidad de los pacientes de UCI.

Palabras clave:
COVID-19
SARS-CoV-2
Coinfección
Sobreinfección
Brote
Acinetobacter baumannii

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