Identification of Streptococcus pneumoniae lytA, plyA and psaA genes in pleural fluid by multiplex real-time PCR

Abstract

Introduction

The aim was to evaluate the utility of a multiplex real-time PCR to detect Streptococcus pneumoniae lytA, plyA and psaA genes in pleural fluid (PF).

Methods

A collection of 81 PF samples was used. Sixty were considered positive for S. pneumoniae according to previous results (54 by an in-house lytA gene PCR and eight by universal rRNA PCR).

Results

The sensitivity for detection of the lytA, plyA and psaA genes by multiplex PCR was 100% (60/60), 98.3% (59/60) and 91.7% (55/60), respectively. The detection of all three genes was negative in 21 samples formerly confirmed as negative for S. pneumoniae (100% specificity) by the other procedures (9 by in-house lytA PCR and 12 by rRNA PCR).

Conclusions

The use of this multiplex PCR may be a useful option to identify S. pneumoniae directly in PF samples.

Resumen

Introducción

El objetivo fue evaluar la utilidad de una técnica de PCR múltiple para detectar los genes lytA, plyA y psaA de Streptococcus pneumoniae en líquido pleural.

Métodos

Se empleó una colección de 81 muestras de líquido pleural. Sesenta habían sido consideradas positivas para S. pneumoniae según resultados previos (54 por una prueba casera de PCR para el gen lytA y 8 por una PCR universal rRNA).

Resultados

La sensibilidad de la técnica para la detección de los genes lytA, plyA y psaA fue respectivamente 100% (60/60), 98,3% (59/60) y 91,7% (55/60). La detección de los tres genes resultó negativa en 21 muestras negativas (especificidad 100%) por los otros procedimientos (9 por la prueba casera de PCR para lytA y 12 por la PCR rRNA).

Conclusiones

El uso de esta técnica de PCR múltiple puede ser una opción útil para la detección directa de S. pneumoniae en líquido pleural.