Chlamydia trachomatis is one of the main etiological agents of sexually transmitted infections worldwide. In 2006, a Swedish variant of C. trachomatis (Swedish-nvCT), which has a deletion of 377bp in the plasmid, was reported. In Latin America, Swedish-nvCT infections have not been reported. We investigated the presence of Swedish-nvCT in women with infertility in Mexico.

Swedish-nvCT was searched in 69C. trachomatis positive samples from 2339 endocervical specimens. We designed PCR primers to identify the deletion in the plasmid in the ORF1, and the presence of a repeated 44bp in the ORF3. The sample with the deletion was genotyped with the genes of the major outer membrane protein A (ompA) and the polymorphic membrane protein (pmpH).

The deletion was detected in one of the 69 samples positive C. trachomatis of 2339 endocervical exudates. The nucleotide sequence analysis of the ompA shows a high degree of similarity with the Swedish nvCT (98%), however the variant found belongs to serovar D. The nucleotide sequence of the pmpH gene associates to the variant found in the genitourinary pathotype of the Swedish-nvCT but in different clusters.

Our results revealed the presence of a new variant of C. trachomatis in Mexican patients. This variant found in Mexico belongs to serovar D based on the in silico analysis of the ompA and pmpH genes and differs to the Swedish-nvCT (serovars E). For these variants of C. trachomatis that have been found it is necessary to carry out a more detailed analysis, although the role of this mutation has not been demonstrated in the pathogenesis.

Chlamydia trachomatis es una de las principales bacterias que causan infecciones de transmisión sexual en todo el mundo. En 2006 se informó de una variante sueca de C. trachomatis (nvCT-sueca), que tiene una deleción de 377 bp en su plásmido. En América Latina no se ha informado de infecciones por la nvCT-sueca. El propósito de esta investigación fue la búsqueda de la nvCT-sueca en mujeres mexicanas con infertilidad.

Se analizaron 69 muestras positivas para C. trachomatis de 2.339 muestras endocervicales. Se diseñaron cebadores que identificaron la deleción de 377pb en ORF1, y detección de un tándem de 44pb repetidos en ORF3, como ocurre en la nvCT-sueca. Las muestras con la deleción fueron genotipificadas mediante los genes de la proteína principal de la membrana externa A (ompA) y de la proteína polimórfica de membrana H (pmpH).

La deleción se detectó en una de las 69 muestras (1,44%). El análisis de la secuencia del gen ompA mostró un alto grado de similitud con la nvCT-sueca (98%). Sin embargo, la variante encontrada perteneció al serovar D. La secuencia del gen pmpH se asoció al patotipo genitourinario, pero en diferentes clusters al de la nvCT-sueca.

Los resultados revelaron la presencia de una nueva variante de C. trachomatis en México con delección y que pertenece al serovar D con base al análisis in silico de los genes ompA y pmpH, y que difiere de la nvCT-sueca (serovares E). Se requiere conocer su prevalencia en México y en América Latina.